Để thực hiện được việc cập nhật số liệu kế toán, NSD cần phải mở DLKT đã tạo. Sau khi mở dữ liệu thành công, xuất hiện màn hình chính của chương trình:

Phần mềm MISA SME.NET 2010 được tích hợp từ 13 phân hệ, trong đó có 10 phân hệ tương ứng với 10 phần hành kế toán và 3 phân hệ khác hỗ trợ cho hoạt động kinh doanh của doanh nghiệp, bao gồm:

-         Theo dõi tình hình chi tiêu theo dự toán của từng văn phòng, chi nhánh (Phân hệ Ngân sách)

-         Kế toán tiền mặt tại quỹ (Phân hệ Quỹ)

-         Kế toán tiền gửi ngân hàng (Phân hệ Ngân hàng)

-         Kế toán mua hàng (Phân hệ Mua hàng)

-         Kế toán bán hàng (Phân hệ Bán hàng)

-         Kế toán vật tư, hàng hóa, CCDC (Phân hệ Kho, CCDC)

-         Kế toán TSCĐ (Phân hệ TSCĐ)

-         Kế toán tiền lương (Phân hệ Tiền lương)

-         Kế toán giá thành (Phân hệ Giá thành)

-         Kế toán thuế (Phân hệ Thuế)

-         Quản lý hợp đồng mua, hợp đồng bán (Phân hệ Hợp đồng)

-         Quản lý cổ đông (Phân hệ Cổ đông)

-         Kế toán tổng hợp số liệu lập báo cáo tài chính (Phân hệ Tổng hợp)


Theo Misa